土壤中含有大量鋁的氫氧化物，土壤酸化后，酸化土壤改良可加速土壤中含鋁的原生和次生礦物風(fēng)化而釋放大量鋁離子，形成植物可吸收的形態(tài)鋁化合物。植物長(zhǎng)期和過量的吸收鋁，會(huì)中毒，甚至死亡。酸雨尚能加速土壤礦物質(zhì)營(yíng)養(yǎng)元素的流失；改變土壤結(jié)構(gòu)，導(dǎo)致土壤貧脊化，影響植物正常發(fā)育；酸雨還能誘發(fā)植物病蟲害，使作物減產(chǎn)。
酸化土壤肥力減退、農(nóng)業(yè)減產(chǎn)酸雨可使土壤微生物種群變化，細(xì)菌個(gè)體生長(zhǎng)變小，生長(zhǎng)繁殖速度降低，如分解有機(jī)質(zhì)及其蛋白質(zhì)的主要微生物類群牙孢桿菌，極毛桿菌和有關(guān)真菌數(shù)量降低，影響營(yíng)養(yǎng)元素的良性循環(huán)，造成農(nóng)業(yè)減產(chǎn)。特別是酸雨可降低土壤中氨化細(xì)菌和固氮細(xì)菌的數(shù)量，使土壤微生物的氨化作用和硝化作用能力下降，對(duì)農(nóng)作物大為不利。 科學(xué)家試驗(yàn)后估計(jì)我國(guó)南方七省大豆因酸雨受災(zāi)面積達(dá)2380萬畝，減產(chǎn)達(dá)20萬噸，減產(chǎn)幅度約6%，每年經(jīng)濟(jì)損失1400萬元。
火力發(fā)電廠周圍的糧地稻、麥等禾本科作物葉面積小，蠟質(zhì)層厚，可濕性差，對(duì)酸雨敏感性弱，但強(qiáng)酸雨仍將導(dǎo)致葉面扭曲，褐黃或褐紅傷班，大麥減產(chǎn)。重慶電廠附近酸雨區(qū)域受害糧地4.1% .
赤稻
水稻生長(zhǎng)期是翠綠色的，到了成熟期是黃色的，在加上誘人的稻米香味，稻香村成為田園特殊風(fēng)光；如果變成赤色的，又如何？我們見過赤豆，紅高糧，誰(shuí)也沒見過赤稻。怪事發(fā)生在重慶， 1982 年6 月18日下了一場(chǎng)pH值為3.9 的強(qiáng)酸雨，某鄉(xiāng)上萬畝水稻葉片迅速變成赤色，一場(chǎng)災(zāi)害產(chǎn)量損失80萬斤。酸雨大棚實(shí)驗(yàn)也證明，強(qiáng)酸雨將導(dǎo)致葉面產(chǎn)生赤色傷班。 酸沉降對(duì)農(nóng)作物的急性傷害和慢性傷害急性傷害，通常是指農(nóng)作物與強(qiáng)酸雨或高濃度二氧化硫等污染物接觸，其葉片在短時(shí)間（一至三天）內(nèi)出現(xiàn)細(xì)胞死亡，其嚴(yán)重者出現(xiàn)枯葉，枯枝，枯梢和枯株。這種情況只在實(shí)驗(yàn)室和土法煉硫窯附近見過。慢性傷害，一般系指農(nóng)作物長(zhǎng)期與弱酸雨或低濃度的二氧化硫污染物接觸，其葉色失綠或色素變化，破壞作物細(xì)胞正常代謝活動(dòng)，導(dǎo)致細(xì)胞死亡，其可見傷害癥狀為過早落葉等。一般酸雨地區(qū)或二氧化硫長(zhǎng)期超標(biāo)地區(qū)內(nèi)，會(huì)發(fā)生這種情況。這也是大面積農(nóng)作物減產(chǎn)的原因。 不同作物受二氧化硫傷害的敏感性不同的農(nóng)作物和同種作物的不同品種之間，受二氧化硫傷害的敏感性不同。為了使人們認(rèn)識(shí)這點(diǎn)，科學(xué)家在實(shí)驗(yàn)室內(nèi)用一定劑量的二氧化硫去熏不同農(nóng)作物。一段時(shí)間之后，不同農(nóng)作物傷害完全不同，可分為敏感性農(nóng)作物，中等敏感性農(nóng)作物和抗性農(nóng)作物三類。如，敏感農(nóng)作物有大麥，棉花，大豆，菠菜，胡蘿卜和辣椒等；中等抗性農(nóng)作物為小麥，菜豆，花生，黃瓜，油菜和番茄等；抗性農(nóng)作物為水稻，玉米和馬鈴薯等。
酸雨與蔬菜酸雨造成蔬菜葉面黃斑，生長(zhǎng)不良，抗病能力下降，產(chǎn)量下降。
如我國(guó)某電廠附近酸雨區(qū)域受害菜地11.3% . 不同品種的蔬菜對(duì)酸雨的敏感程度不同，當(dāng)pH=3.5的高酸性環(huán)境里，對(duì)酸敏感蔬菜蕃茄，芹菜，豇豆和黃瓜產(chǎn)量可下降20% ；而有中等敏感性的生菜，四季豆和辣椒產(chǎn)量下降10-20%；最后，抗酸性較強(qiáng)的青椒，甘蘭，小白菜，菠菜和胡羅卜產(chǎn)量下降低于10%.